Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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