Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms