Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm26021-201ENSMUST00000158664 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm46376-201ENSMUST00000222653 654 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms