Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms