Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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FarsaQ8C0C7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FarsaQ8C0C7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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