Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ube2q1Q7TSS2 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ube2q1Q7TSS2 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ube2q1Q7TSS2 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ube2q1Q7TSS2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ube2q1Q7TSS2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms