Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smchd1Q6P5D8 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smchd1Q6P5D8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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