Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q6DFW0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms