Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edc4Q3UJB9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms