Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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