Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ctdnep1Q3TP92 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ctdnep1Q3TP92 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ctdnep1Q3TP92 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ctdnep1Q3TP92 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ctdnep1Q3TP92 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ctdnep1Q3TP92 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms