Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hddc2Q3SXD3 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Hddc2Q3SXD3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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