Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Thbs2Q03350 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Thbs2Q03350 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thbs2Q03350 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms