Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top2aQ01320 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top2aQ01320 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms