Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Grin2bQ01097 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms