Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Trpv5-202ENSMUST00000193503 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Pla2g6-210ENSMUST00000174021 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Bcl6b-201ENSMUST00000000326 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ankdd1b-201ENSMUST00000055607 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Cited1P97769 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms