Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SgcdP82347 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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