Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
FmodP50608 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms