Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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