Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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SftpcP21841 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SftpcP21841 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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