Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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