Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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