Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atf6F6VAN0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms