Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Taf4E9QAP7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms