Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms