Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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