Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccdc97Q9DBT3 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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