Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU2

Zdhhc13, Palmitoyltransferase ZDHHC13, mousemouse

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Length 622 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc13Q9CWU2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zdhhc13Q9CWU2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zdhhc13Q9CWU2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms