Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms