Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Stx18Q8VDS8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms