Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hecw1Q8K4P8 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hecw1Q8K4P8 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms