Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Usp27Q8CEG8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Usp27Q8CEG8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Usp27Q8CEG8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp27Q8CEG8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Usp27Q8CEG8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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