Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms