Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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