Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp54Q8BL06 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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