Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms