Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc29Q80VM3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ttc29Q80VM3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ttc29Q80VM3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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