Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nup98Q6PFD9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Nup98Q6PFD9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nup98Q6PFD9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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