Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms