Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms