Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trp53i11Q4QQM4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms