Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39dQ0VF76 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Ttc39dQ0VF76 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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