Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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NcanP55066 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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NcanP55066 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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NcanP55066 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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NcanP55066 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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NcanP55066 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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NcanP55066 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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NcanP55066 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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NcanP55066 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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NcanP55066 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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NcanP55066 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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NcanP55066 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NcanP55066 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms