Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms