Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtpreP49446 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms