Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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