Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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