Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PrkcdP28867 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms