Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms