Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Cnih1O35372 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cnih1O35372 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms